بحول و قوه الهی انجمن باکتری شناسی ایران در سال 1388 موفق به اخذ پروانه فعالیت از وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی گردید. انجمن با دعوت از اساتید ممتاز میکروب شناسی با گرایشهای باکتری شناسی پزشکی دانشگاههای علوم پزشکی سراسر کشور تشکیلاتی را بنیاد نهاد تا با نگرش تخصصی به رشته باکتری شناسی پزشکی قادر به ارائه راه حلهای جدید با دیدگاههای کلان نگر در این حوزه باشد.
خوشبختانه در حال حاضر تشکل های علمی ویروس شناسی ، انگل شناسی ، ایمونولوژی و اخیراً قارچ شناسی با ورود به عرصه های صنفی قدمهای موثری برداشته اند. انجمن باکتری شناسی با حضور در کنار انجمنهای تخصصی فوق امیدوار است به رسالت خود در فراهم آوری ارتباطات علمی ، آموزشی ، پژوهشی و صنفی باکتری شناسی پزشکی ایران گام بردارد.